水利学院共计11个党支部，分别为：土木工程党支部、水土保持与荒漠化防治党支部、水利水电工程党支部、农业水利工程党支部、测绘工程党支部、本科生第一党支部、本科生第二党支部、博士党支部、2021级硕士党支部、2022级硕士党支部、2023级硕士党支部。

截至2023年12月全院党员共计196人，教工党员75人，学生党员121人。

1.农业水利工程党支部：党支部书记：魏新光；组织委员：夏桂敏；宣传委员：郑俊林

2.水利水电工程党支部：党支部书记：付玉娟；组织委员：胡志华；宣传委员：姬建梅

3.土木工程党支部：党支部书记：白义奎；党支部副书记：谢立群；组织委员：刘艳华；宣传委员：赵荣飞

4.水土保持与荒漠化防治党支部：党支部书记：贾玉华；组织委员：马仁明；宣传委员：贾燕锋

5.测绘工程党支部：党支部书记：高振东；组织委员：张婷婷；宣传委员：林茂森

6.本科生第一党支部：党支部书记：刘璐

7.本科生第二党支部：党支部书记：潘雪峰

8.博士党支部：党支部书记：张昊希；组织委员：付诗宁；宣传委员：刘畅

9.2021级硕士党支部：党支部书记：宋一凡；组织委员：王紫钰；宣传委员：曹琦

10.2022级硕士党支部：党支部书记：李晓楠；党支部副书记：张津铭；组织委员：王玉隆；宣传委员：范子辰

11.2023级硕士党支部：党支部书记：陈琪；组织委员：刘一峰；宣传委员：付佳